L’épigénome correspond à l’enveloppe moléculaire du génome d’une cellule et reflète sa fonction. Il s’agit d’un assemblage complexe de différents marqueurs protéiques qui, ensemble, confèrent des signatures uniques aux divers types cellulaires. Ainsi, l’étude de l’épigénome permet de distinguer les cellules cancéreuses des cellules normales et pourrait constituer un moyen très efficace d’offrir une évaluation personnalisée des cancers individuels.

Cependant, les signatures de l’épigénome sont très complexes et ne sont pour l’instant comprises que de manière partielle. Cette étude vise à développer des approches d’intelligence artificielle (IA) reposant sur des méthodes de pointe afin d’interpréter de façon cohérente le paysage épigénomique et d’en faire un outil utile pour la prise en charge du cancer.

Les travaux seront menés par une équipe combinant une expertise de pointe en intelligence artificielle et en apprentissage profond, ainsi qu’un solide savoir-faire en biologie moléculaire, génétique, régulation génique, génomique, épigénomique et biologie du cancer. Cette complémentarité permettra d’aborder le projet sous un angle à la fois technologique et biomédical, garantissant une approche intégrée et hautement spécialisée.